因为长江口水师做了榜样，燕王朱棣从水路向南京杀过去的时候众人已经感觉到燕王朱棣困龙升天翻盘了的事情。
所以，众人开始便把建文帝朱允炆的命令不当回事，燕王朱棣依靠从楚藩获得的红衣大炮基本上没有遇上大麻烦。
小股麻烦基本上把舰队红衣大炮轻松敲掉，建文帝朱允炆已经通过手底下探子知道了燕王朱棣向自己南京城杀过来顺风顺水的事情。
建文帝朱允炆的万般无奈只好开始期盼自己北方军队南下支援南直隶应天府南京城自己可以坚守住自己叔叔朱棣的猛烈攻势。
在开始布置南京城防御的时候，建文帝朱允炆开始思考自己退路的事情。所以，赋闲在皇宫里面无聊，开始在皇宫里面逛起来。
不知不觉间建文帝朱允炆便来到挂自己爷爷洪武大帝朱元璋画像的宫殿里面。建文帝朱允炆来到画像面前看着洪武大帝朱元璋的画像入迷，突然发现画像自己爷爷洪武大帝的手指不对劲。
画像里面洪武大帝竟然手指下方，建文帝朱允炆便好奇心发作开始让跟着自己的随从在画像周围寻找有没有老爷子留下的什么东西。
不久，经过一番探查建文帝朱允炆便在自己老爷子下方发现了一个地道和和尚僧炮一件以及一封给自己的亲笔信。
建文帝朱允炆拆开亲笔信便发现了洪武大帝留给自己的家业便被自己叔叔燕王朱棣夺取自己无路可走便依靠密道跑路出嫁当和尚了无牵挂的事情。
建文帝朱允炆看着自己老爷子留下的亲笔信五味杂陈，晃晃悠悠的离开自己老爷子画像的宫殿返回自己寝宫休息。与此同时，燕王朱棣带领舰队乘风破浪开始向自己梦寐以求的皇位而来。
燕王朱棣非常兴奋已经兴奋到不知道如何表达的地步，在燕王朱棣向南京而来的同一时间徐辉祖开始带领几万人马乘坐船只也跟着从山东半岛离开南下。
还有二线淮河防线的军队开始拖拖拉拉的向南京前进，因为淮河防线的军队前途未卜不知道回到南京城的时候南京城里面是建文帝还是燕王。
将领们为了自己前途考虑而影响军队返回速度，要是建文帝朱允炆或海路南下的徐辉祖知道二线淮河防线的军队拖拖拉拉的情况不知道会怎么办！
不久，建文帝等待度日如年的时候燕王朱棣带领舰队来到南京城下关码头。接着依靠犀利饱和式火炮击溃下关码头盛庸几万守军，在红衣大炮的掩护下四万人马开始登陆下关码头。在下关码头阻击失败以后南京方面军队便退守南京城死守。
在燕王朱棣下关码头击溃盛涌几万守军传入南京城的时候，南京城里面开始暗流涌动起来。毕竟，现在燕王朱棣要一步登天了，南京城里面郁郁不得志的人员人心思异起来。
结果，郁郁不得志的李景隆和谷王朱惠便利用职务之便开始和燕王朱棣通气表示自己可以帮助燕王朱棣打开南京城大门让燕王几万人马入驻南京城里面。
因此，燕王朱棣在下关码头便放弃了动用红衣大炮打开南京城的行动。因为搬运红衣大炮要费时费力太麻烦，在内鬼的帮助下燕王朱棣开始在下关码头安营扎寨。
燕王朱棣开始假装搬运红衣大炮在进攻南京城的样式，收到书信的当天晚上便全军动员起来一刻不停向南京城杀过去。
在李景隆和谷王朱惠的帮助下轻而易举从南京城金川门进入，守备南京城里面二十余万人马除了一部分死忠于建文帝朱允炆的一些人马以外大部分军队当做看不见让燕王朱棣入驻南京城。
在南京城皇宫里面建文帝朱允炆知道自己叔叔朱棣在李景隆和谷王朱惠的帮助下入驻南京城后便开始在自己皇宫里面放火。
接着开始按照自己爷爷洪武大帝的书信方法开始准备脱离南京城远离自己叔叔朱棣安享晚年。在燕王朱棣入驻南京城以后便开始下令自己手底下军队向皇宫杀过去。
燕王朱棣准备进攻南京城皇宫内城和自己侄子朱允炆了结靖难之役的时候发现南京城皇宫突然失火。让本来燕王朱棣要耗费一些功夫拿下皇宫的事情变成救火行动。
燕王朱棣开始带领手底下几万人马开始救火，在扑灭皇宫里面大火以后发现自己侄子朱允炆不知所踪。没有办法为了稳住大明王朝局面燕王朱棣开始在南京城里面仓促称帝和清算建文帝朱允炆党羽的事情。
在南京城失守的第一时间，南京城附近成百上千的探子开始向四面八方而去。开始把燕王入驻南京城的消息第一时间给自己顶头上司汇报。
随着燕王朱棣入驻南京城而靖难之役历时两年多终于结束，消息传到北方山东前线以后交战双方便停下来。众人开始等待燕王朱棣如何在南京城里面妥善解决靖难之役的事情现在已经和前线战场交战双方没有关系了。
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